问题分析：夜间睡觉时出现肛门疼痛醒来，可能是由于痔疮、肛裂等疾病引起，需要根据具体情况在医生指导下针对性治疗。
1、痔疮：痔疮是指直肠下段的肛垫异常扩大，可能导致大便不尽、腹泻、疼痛等症状。一般情况下，可以在医生的指导下选择外用药物治疗，例如利多卡因乳膏可缓解疼痛，氢化可的松药膏可治疗炎症。如果药物治疗效果不佳，可能需要进行外科手术治疗，如外剥内扎术。此外，在晚上可以进行温水坐浴，有助于减轻炎症和水肿，缓解肛门疼痛的症状。
2、肛裂：肛裂是指肛管皮肤全层出现裂纹的疾病，常常由于大便异常和内括约肌痉挛等原因引起。临床表现包括疼痛、便血和便秘。可以在医生的指导下用高锰酸钾温水坐浴清洁肛门区域，主要的治疗方法是手术，例如肛裂内括约肌侧切术。
另外，肛门直肠周围神经紊乱也可能导致夜间肛门疼痛，这种情况通常是暂时的，持续几分钟后会自行缓解。常是由于短期内饮食和作息不规律，过度劳累等因素引起的，若持续疼痛，建议及时就医治疗，避免病情延误。
